Генподрядные услуги это не подрядные работы и поэтому в форму КС-2 не включаются. Оплачиваются генподрядные услуги за счет накладных расходов субподрядчика (по счету). Можно посмотреть письмо Управления ценообразования Госстроя РФ от 17 марта 2000г. №10-92 по вопросу генподрядных услуг.